狮子亚历克斯、斑马马蒂、长颈鹿迈尔曼、河马格洛丽亚以及企鹅们，被困在马达加斯加岛上进退两难。为了离开这个荒无人烟的岛屿，企鹅们开始维修一架破旧的失事飞机，并准备驾驶这架飞机带众动物离开马达加斯加岛。由于维修技术欠佳..
