这是一个表面被71%的海水覆盖着的蓝色星球，人类在这片碧蓝色之中出生、成长、孕育和发展属于自己的文明。然而，伴随着它们的，还有不断膨胀的野心和欲望。表面风平浪静的世界格局之下，历史的暗流涌动。终于，未知的敌人在海洋中出现。面对敌方压倒性的战力，各个阵营却仍然各自为战，最终换来的结果亦是惨痛的：人类失去了90%以上的海域控制权，科技和生活水平急速倒退。人类对于海洋以及未知的敌人产生了深深的阴影，并且将那些将他们拖入深海黑暗之中的怪物称之为『塞壬』。数十年之后，各大阵营为了夺回曾经的辉煌，终于摒弃前嫌，联合创建了第三方军事组织『碧蓝航线』。