无聊的我，在朋友的提醒下，进入国际量子信息集成网（苏菲世界）。这是一个不受人类干涉的、自由进化的数字世界。在那里，我上了“卡纳克”号，遇到了心中的英雄波罗先生。我惘顾数字助手珍妮的劝阻，擅自救了路易斯小姐和奥特波恩太太，改变了苏菲世界的历史。由此引发了国际量子信息集成网Caref系统故障，而我也困在那里不能回到人类世界。我因为被系统送上“卡纳克”号时，正赶上林内特被杀。所以波罗先生指控我有杀死林内特的嫌疑，我不可能说明真相，有被抓的危险。但在珍妮的暗中帮助下，波罗先生最终明察秋毫，纠出了真凶。但由于我改变苏菲世界的历史，又引发了更严重的后果，Caref系统因故障而生成了一个十分危险的程序——邪恶节点！它要一并毁灭人类世界及苏菲世界。邪恶节点设局使我上当，利用我改变了人类世界与苏菲世界共同的历史框架，妄图毁灭一切！关键时刻，珍妮挺身而出，为消灭邪恶节点而战！